Перейти к основному содержанию

Неизвестных болезней больше не будет

Что такое секвенирование, в чем заключается этот метод определения заболевания и чем он отличается от уже известных.

О разработках в сфере молекулярной диагностики корреспонденту VitaPortal.ru рассказал руководитель отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии ФГУН ЦНИИЭ Роспотребнадзора, кандидат медицинских наук Герман Шипулин.

В Америке некоторое время назад появились тесты с микрочипами, определяющие уровень глюкозы в крови или ВИЧ. Наши разработчики стремятся сделать что-то подобное?

– Вы имеете в виду тесты Point-of-care? Они действительно есть, но это единичные случаи. Есть экспресс-тесты на беременность с микрочипами, тесты с двумя основными маркерами инфаркта. У нас такие тоже уже продаются, но они недостаточно точные, все равно приходится идти в лабораторию и сдавать анализы.  

В России делают тесты с микрочипами, но для лабораторий, не для потребителей. Институт молекулярной биологии разрабатывает геномные – они позволяют выявить ДНК и РНК самого организма, а ЦНИИ эпидемиологии делает белковые. Я думаю, со временем геномные сенсоры будут вытеснены секвенированием.

Что дает этот метод?

– Секвенирование позволяет выявить нуклеотидную последовательность даже в том случае, если мы не знаем, что именно перед нами. То есть оно способно полностью определить неопознанный объект. Микрочип может распознать только заданные молекулы, а секвенатор – прибор универсальный, различает все, что не известно.

Есть вероятность, что такие приборы будут производить и в России?

– У нас разработкой секвенаторов пока не занимаются, но они есть в наших лабораториях. В этом году ведущими зарубежными представителями было выпущено сразу три машины, они настольные, небольшие, стоят в районе 3 млн рублей, а это сегодня может себе позволить любая баклаборатория. Наш институт купил сразу два, первый запустили месяц назад.

Что-то уже удалось исследовать на новом аппарате?

– Да, уже отсеквенировали геном вакцины БЦЖ, которая используется для иммунизации против туберкулеза. Пока мы ее просто изучаем, геном бактерии – это очень сложно, в нем десятки тысяч составляющих, в геноме закодированы все свойства, как в книге записана информация в виде букв.

Мы хотим понять, чем нехорош наш штамм, конечная цель работы – улучшить нашу вакцину против туберкулеза. В России самая большая эпидемия туберкулеза в мире, но при этом все привиты. Эффективность вакцинации оказывается очень малозначима.

Пока мы секвенируем микроорганизмы, которые были открыты нашими отцами, а дальше перейдем к работе с новым материалом.

Когда секвенаторы появятся в больницах?

– Сейчас я собираюсь писать проект для правительства Москвы, чтобы во Второй инфекционной больнице сделали центр по расшифровке случаев неясной этиологии. Пока над больным с неясным заболеванием врачи, по сути, экспериментируют, пробуют то одно, то другое лекарство, пытаются ему помочь. У нас другой подход: мы считаем, что с помощью секвенирования и белковых чипов мы сможем за один день установить диагноз. Из всех инфекционных заболеваний 80% вызывают известные микроорганизмы и 20% – не изученные до сих пор. Мы хотим знать каждый из них, чтобы, если человек неожиданно заболел, мы в течение дня могли выяснить, от чего его лечить.